Immune Responses, Week 3 assignment help
Anonymous

Question Description

Immune Responses

Abnormal immune responses can trigger a range of autoimmune diseases, in which an individual’s immune system is attacking normal tissues in the body. Well-known examples of autoimmune diseases are type 1 diabetes mellitus, lupus, and multiple sclerosis.

Ideally, one would like to harness the immune system to attack abnormal substances or tissues like cancer, while sparing the normal (unaffected) tissue. Many tumor cells produce antigens (proteins) that theoretically ought to trigger an immune response: that is, one’s immune system ought to recognize cancer cells as somehow foreign or abnormal, and thereafter eliminate these cells from the body. The field of cancer immunotherapy is actively pursuing this study.

Tumor antigens may also be useful for diagnostic tests; high levels of tumor antigens could be taken as markers or indicators of cancer. In this assignment, you will be examining levels of tumor-associated antigens (TAAs) as determined from immunoassays (i.e., biochemical tests that measure the concentrations of the tumor-associated antigens in serum samples).

  • Download the Excel file MHA610_assignment_3_data.xls, and open it.
  • The spreadsheet contains data on 250 individuals: 90 normal individuals from San Diego (the controls), and 160 individuals from Korea and China, all of whom were diagnosed with hepatocellular carcinoma (HCC).
    • Serum samples were taken from the controls and from the cases at time of diagnosis of HCC. Levels of a panel of 12 tumor-associated antigens (TAAs) were assessed via immunoassays in all individuals;
      • The levels are given in the columns with headings Ab14, HCC1, IMP1, KOC, MDM2, NPM1, P16, P53, P90, RaIA, and Survivin. (These are the designations of the 12 TAAs, all of which were thought to be potentially predictive of cancer.)
  • The underlying question is whether we can effectively discriminate between the cases and controls on the basis of the levels of these TAAs. This is sometimes termed a classification problem in the statistics and biostatistics literature: we wish to classify individuals as normal or cancer patients on the basis of their TAA levels.
  • We will examine these data in Statdisk. Use the MHA610_Week 3_Assignment_Data.CSV file to upload this information into Statdisk.
    • If you choose the latter option, Start Statdisk, then choose File>Open and select the .csv file you created (unless you changed the name, it ought to be MHA610_assignment_3_data.csv)
    • Check the box that specifies the data contains column titles or headers, select Comma separated for how the data are delimited, click finish, and the dataset will have been successfully imported into Statdisk.
    • NOTE: you may want to read through the remainder of the assignment first, before proceeding with this step. This may save you some work afterwards!
  • Note that Statdisk operates on columns of data, and that both cases and controls are contained in each column of TAA levels. It will be necessary to separate the cases and controls for further analyses. This can be accomplished either by copying within Statdisk or by reverting to the original Excel workbook, copying in Excel, exporting as a .csv file, and then importing into Statdisk. (Don’t say you weren’t warned!)
  • Explain if you would characterize any or all of the TAA levels as approximately normally distributed for the controls and for the cases.
    • Provide plots and statistics in support of your conclusions.
  • Explain if any of the TAAs are useful for discriminating between the cases and controls.
    • Provide plots and statistics in support of your conclusions.
  • All writing assignments should be at least 250-500 words in APA format supported by scholarly sources.

BONUS. In the above, we pooled all cases together. Summarize whether you think this is legitimate or whether the levels of any of the TAAs appear to differ significantly between the cases from China and the cases from Korea. Provide

Final Answer

Attached.

Running Head: CANCER AND IMMUNE SYSTEM MARKERS

Cancer and Immune System Markers
Name
Course
Tutor
Date

1

CANCER AND IMMUNE SYSTEM MARKERS

2

We are assessing the distinction between certain TTA (tumor related antigens) between
two controls. Control A comprises of ninety healthy people from San Diego, while control B
comprises of one-hundred and sixty people of Chinse and Korean respectable as of now
determined to have HCC (hepatocellular carcinoma). As indicated by NCBI, hepatocellular
carcinoma (HCC) is the most widely recognized essential danger of the liver. Speaking to 1 of
the main sources of malignancy death on the planet with an expected 21,670 deaths in the United
States in 2013 (Fonge and Tananbe, 2014). It has been demonstrated that in the United State
most patients determined to have HCC have liver have been defiled with Hepatitis C, while in
Asia they patients determined were tainted to have Hepatitis B.
The TAA that was explored while picking what pieces were available in tumors found in
corrupted livers were Ab14, HCC1, IMP1, KOC, MDM2, NPM1, P16, P53, P90, RaIA, and
Survivin, Many of the levels found were excessively near zero and would be not proficient be
generally appropriated. It gives both social events and the IMP 1 kept running inside standard
appropriating ranges among every one of the three amassing adjacent to a couple of individual
cases and the same can be said for the MDM2 in each of the three cases.

HBV and HCV can spread from individual to individual through sharing tainted needles,
(for example, in medicate utilize), unprotected sex, or labor. They can likewise be gone on
through blood transfusions, in spite of the fact that this is exceptionally uncommon in the United

CANCER AND IMMUNE SYSTEM MARKERS

3

States since the start of blood item testing for these infections. In creating nations, kids once in a
while contract hepatitis B disease from delayed contact with relatives who are contaminated
(American Cancer Society, 2016). Many instances of HCC in Asia have been connected to HBV,
75% to 80 % of the instances of HCC on the planet that are analyzed are situated in Asia. Despite
the fact that the number in the United States are on the ascent Asia has essentially developed
after some time.
z Value: 2.760000
Prob Dens: 0.0088465

Cumulative Probs
Left:
Right:

0.997110
0.002890

2 Tailed:

0.005780

Central:

0.994220

As Table A-2: 0.997110

CANCER AND IMMUNE SYSTEM MARKERS
References
American Cancer Society. (2016, April 28). Liver Cancer Causes, Risk Factors, and
Prevention TOPICS. Retrieved October 9, 2016, from
www.cancer.org/cancer/livercancer/detailedguide/liver-cancer-risk-factors
Fong, Z. V., & Tanabe, K. K. (2014, September 15). The clinical management of
hepatocellular carcinoma in the United States, Europe, and Asia: a
comprehensive and evidence-based comparison and review. - PubMed - NCBI.
Retrieved October 8, 2016, from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24897995

4


groupid
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0

Ab14
HCC1
IMP1
KOC
MDM2
NPM1
P16
P53
0,102
0,068
0,083
0,023
0,117
0,12
0,102
0,098
0,02
0,06
0,035
0,016
0,005
0,004
0,017
0,014
0,064
0,13
0,111
0,058
0,092
0,046
0,258
0,057
0,068
0,041
0,056
0,019
0,077
0,05
0,067
0,055
0,036
0,07
0,067
0,04
0,026
0,019
0,057
0,027
0,049
0,188
0,079
0,063
0,073
0,018
0,107
0,053
0,053
0,231
0,214
0,105
0,05
0,009
0,277
0,061
0,071
0,045
0,133
0,19
0,086
0
0,098
0,055
0,066
0,139
0,105
0,065
0,095
0,041
0,193
0,075
0,071
0,077
0,095
0,039
0,132
0,058
0,22
0,077
0,033
0,091
0,064
0,059
0,012
0,01
0,039
0,034
0,053
0,024
0,06
0,026
0,147
0,102
0,114
0,064
0,045
0,014
0,05
0,02
0,045
0,144
0,051
0,039
0,153
0,08
0,071
0,034
0,021
0,118
0,063
0,041
0,033
0,023
0,047
0,019
0,048
0,219
0,056
0,043
0,111
0,047
0,104
0,049
0,103
0,064
0,285
0,09
0,082
0,023
0,071
0,258
0,091
0,129
0,116
0,055
0,115
0,01
0,383
0,162
0,113
0,229
0,298
0,075
0,054
0,027
0,327
0,026
0,035
0,067
0,389
0,224
0,048
0,123
0,119
0,06
0,043
0,036
0,118
0,085
0,1
0,055
0,058
0,026
0,145
0,119
0,397
0,087
0,079
0,07
0,144
0,071
0,159
0,144
0,253
0,08
0,099
0,009
0,104
0,102
0,029
0,099
0,685
0,079
0,084
0,026
0,087
0,032
0,093
0,066
0,118
0,069
0,027
0,058
0,085
0,05
0,038
0,027
0,048
0,028
0,071
0,086
0,065
0,046
0,027
0,23
0,087
0,06
0,027
0,068
0,181
0,048
0,027
0,005
0,056
0,027
0,108
0,049
0,153
0,057
0,086
0,055
0,13
0,05
0,055
0,118
0,063
0,048
0,023
0,025
0,047
0,031
0,084
0,068
0,055
0,023
0,121
0,13
0,108
0,073
0,132
0,023
0,1
0,058
0,217
0,054
0,207
0,077
0,077
0,057
0,031
0,016
0,052
0,07
0,077
0,06
0,082
0,048
0,044
0,022
0,074
0,308
0,179
0,051
0,044
0,055
0,187
0,079
0,076
0,016
0,102
0,059
0,054
0,058
0,045
0,021
0,011
0,101
0,468
0,085
0,035
0,034
0,132
0,075
0,041
0,008
0,076
0,046
0,1
0,023
0,107
0,064
0,048
0,029
0,121
0,031
0,063
0,02
0,081
0,097
0,083
0,048
0,044
0,025
0,094
0,026
0,251
0,271
0,124
0,276
0,232
0,067
0,145
0,068
0,16
0,029
0,159
0,446
0,278
0,129
0,051
0,111
0,154
0,111
0,109
0,087
0,151
0,091
0,075
0,131
0,087
0,059
0,038
0,055
0,153
0,097
0,061
0,02
0,092
0,068
0,058
0,152
0,275
0,058
0,035
0,074
0,089
0,04
0,125
0,043
0,065
0,075
0,038
0,045
0,083
0,049
0,057
0,073
0,091
0,067
0,05
0,042
0,189
0,06
0,078
0,036
0,171
0,033

0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1
1
1

0,081
0,051
0,065
0,036
0,103
0,096
0,117
0,037
0,071
0,071
0,052
0,049
0,061
0,043
0,045
0,26
0,025
0,029
0,064
0,048
0,037
0,036
0,057
0,06
0,063
0,056
0,044
0,047
0,032
0,081
0,114
0,026
0,082
0,012
0,068
0,057
0,035
0,051
0,072
0,184
0,033
0,083
0,036
0,084
0,182
0,069
0,072

0,236
0,026
0,027
0,032
0,016
0,02
0,045
0,127
0,036
0,041
0,088
0,039
0,021
0,042
0,077
0,086
0,013
0,004
0,048
0,036
0,014
0,058
0,034
0,044
0,063
0,077
0,03
0,026
0,014
0,04
0,148
0,036
0,031
0,023
0,037
0,01
0,045
0,022
0,012
0,068
0,018
0,052
0,018
0,034
0,068
0,07
0,155

0,269
0,076
0,128
0,024
0,054
0,086
0,168
0,185
0,08
0,05
0,114
0,206
0,026
0,085
0,203
0,141
0,059
0,098
0,132
0,053
0,092
0,082
0,1
0,136
0,135
0,066
0,16
0,064
0,083
0,07
0,342
0,064
0,092
0,092
0,06
0,185
0,077
0,04
0,075
0,129
0,107
0,143
0,092
0,032
0,083
0,126
0,138

0,1
0,064
0,08
0,013
0,026
0,027
0,256
0,072
0,025
0,033
0,035
0,098
0,016
0,052
0,107
0,024
0,05
0,035
0,09
0,055
0,156
0,052
0,031
0,034
0,052
0,035
0,076
0,023
0,06
0,041
0,121
0,026
0,02
0,023
0,02
0,042
0,028
0,018
0,012
0,023
0,065
0,043
0,02
0,014
0,037
0,036
0,08

0,071
0,021
0,074
0,021
0,115
0,167
0,146
0,066
0,097
0,087
0,089
0,125
0,052
0,053
0,065
0,181
0,036
0,025
0,082
0,09
0,047
0,077
0,092
0,113
0,071
0,057
0,069
0,056
0,087
0,037
0,113
0,041
0,085
0,07
0,094
0,157
0,059
0,083
0,099
0,126
0,092
0,099
0,031
0,013
0,17
0,125
0,116

0,078
0,018
0,029
0,043
0,616
0,103
0,405
0,055
0,2
0,029
0,039
0,058
0,355
0,271
0,007
0,529
0,058
0,053
0,19
0,046
0,042
0,034
0,142
0,073
0,056
0,039
0,042
0,037
0,036
0,07
0,161
0,052
0,21
0,004
0,019
0,059
0,054
0,105
0,049
0,059
0,021
0,076
0,038
0,064
0,729
0,336
0,356

0,32
0,091
0,154
0,021
0,082
0,133
0,2
0,15
0,141
0,134
0,084
0,184
0,082
0,096
0,058
0,254
0,192
0,068
0,151
0,089
0,116
0,136
0,193
0,112
0,105
0,093
0,132
0,021
0,077
0,086
0,31
0,052
0,199
0,066
0,085
0,169
0,063
0,051
0,035
0,08
0,073
0,116
0,053
0,107
0,195
0,092
0,105

0,054
0,07
0,047
0,015
0,08
0,072
0,024
0,039
0,055
0,066
0,065
0,055
0,035
0,045
0,059
0,126
0,029
0,018
0,042
0,059
0,027
0,061
0,083
0,066
0,043
0,046
0,074
0,027
0,028
0,041
0,071
0,045
0,035
0,026
0,078
0,074
0,034
0,045
0,054
0,093
0,043
0,067
0,049
0,085
0,057
0,048
0,102

1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

0,49
0,062
0,235
0,113
0,108
0,119
0,12
0,07
0,069
0,101
0,077
0,047
0,493
0,076
0,088
0,064
0,063
0,197
0,053
0,182
0,034
0,077
0,074
0,15
0,199
0,053
0,043
0,106
0,09
0,065
0,137
0,165
0,073
0,091
0,064
0,278
0,174
0,069
0,138
0,064
0,111
0,079
0,07
0,087
0,143
0,117
0,065

0,198
0,149
0,477
0,113
0,072
0,344
0,083
0,124
0,405
0,095
0,112
0,13
0,128
0,126
0,077
0,088
0,045
0,58
0,068
0,182
0,103
0,02
0,103
0,079
0,187
0,128
0,038
0,097
0,099
0,131
0,117
0,142
0,292
0,027
0,063
0,137
0,02
0,088
0,117
0,061
0,036
0,14
0,036
0,151
0,227
0,018
0,122

0,176
0,141
0,304
0,095
0,169
0,37
0,088
0,194
0,143
0,263
0,263
0,316
0,435
1,464
0,66
0,096
0,14
2,069
0,095
0,223
0,159
0,069
0,144
0,275
0,107
0,208
0,065
0,121
0,051
0,14
0,086
0,198
0,208
0,126
0,169
0,222
0,151
0,182
0,194
0,131
0,09
0,275
0,054
0,095
0,098
0,066
0,111

0,147
0,064
0,172
0,073
0,073
0,201
0,068
0,038
0,102
0,04
0,042
0,089
0,588
0,032
0,031
0,057
0,193
0,31
0,061
0,068
0,096
0,023
0,029
0,132
0,086
0,072
0,027
0,064
0,043
0,093
0,062
0,119
0,115
0,069
0,076
0,123
0,027
0,094
0,092
0,113
0,135
0,214
0,067
0,09
0,086
0,022
0,043

0,184
0,153
0,468
0,207
0,194
0,295
0,124
0,07
0,261
0,127
0,08
0,157
0,154
0,133
0,106
0,084
0,149
0,429
0,166
0,065
0,098
0,133
0,162
0,237
0,113
0,151
0,107
0,163
0,077
0,181
0,142
0,153
0,262
0,14
0,077
0,127
0,124
0,172
0,188
0,149
0,096
0,363
0,045
0,075
0,121
0,074
0,125

0,234
0,215
0,504
0,514
0,608
0,613
0,121
0,098
0,126
0,134
0,308
0,206
0,802
0,355
0,26
0,12
0,046
0,214
0,073
0,118
0,149
0,118
1,535
0,455
0,187
0,11
0,402
0,118
0,078
0,26
0,173
1,103
0,158
0,842
0,042
0,147
0,086
0,415
1,245
0,287
0,151
0,292
0,07
0,17
0,086
0,576
0,178

0,394
0,119
0,549
0,145
0,143
0,42
0,196
0,23
0,135
0,676
0,107
0,115
0,484
0,126
0,151
0,101
0,117
0,339
0,097
0,305
0,153
0,143
0,092
0,166
0,441
0,138
0,167
0,177
0,157
0,127
0,284
0,47
0,212
0,132
0,168
0,113
0,498
0,135
0,213
0,215
0,146
0,156
0,176
0,223
0,111
0,172
0,207

0,098
0,151
0,272
0,127
0,089
0,362
0,127
0,217
0,276
0,091
0,087
0,194
0,145
0,427
0,07
0,083
0,154
0,375
0,082
0,616
0,235
0,19
0,142
0,198
0,066
0,277
0,063
0,138
0,065
0,329
0,14
0,153
0,209
0,063
0,125
0,099
0,068
0,263
0,189
0,054
0,123
0,062
0,075
0,075
0,203
0,041
0,06

1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

0,079
0,488
0,075
0,172
0,07
0,056
0,082
0,059
0,071
0,035
0,123
0,081
0,051
0,093
0,038
0,091
0,157
0,286
0,069
0,07
0,07
0,029
0,047
0,074
0,057
0,352
0,064
0,132
0,077
0,11
0,054
0,297
0,083
0,129
0,026
0,048
0,152
0,062
0,156
0,058
0,09
0,034
0,086
0,02
0,11
0,162
0,052

0,124
0,189
0,18
0,061
0,059
0,05
0,108
0,047
0,085
0,382
0,016
0,112
0,068
0,09
0,054
0,036
0,094
0,198
0,252
0,047
0,157
0,374
0,011
0,041
0,112
0,113
0,252
0,158
0,095
0,043
0,347
0,054
0,225
0,299
0,009
0,064
0,073
0
0,212
0,023
0,088
0,063
0,023
0,11
0,144
0,268
0

0,194
0,332
0,193
0,086
0,086
1,603
0,082
0,07
0,151
0,152
0,094
0,174
0,263
0,038
0,085
0,095
0,125
0,108
0,272
0,055
0,1
0,176
0,04
0,122
0,105
0,074
0,169
0,378
0,054
0,075
0,217
0,087
0,164
0,162
0,048
4,031
0,228
0,029
0,172
0,134
0,158
0,074
0,175
0,11
0,182
0,18
0,054

0,064
0,12
0,073
0,061
0,109
0,057
0,057
0,112
0,307
0,13
0,01
0,036
0,071
0,043
0,036
0,058
0,095
0,125
0,158
0,125
0,07
0,128
0,003
0,028
0,084
0,062
0,09
0,083
0,067
0,067
0,178
0,09
0,245
0,11
0,038
0,112
0,248
0,008
0,051
0,055
0,073
0,075
0,02
0,255
2,193
0,039
0,077

0,117
0,257
0,15
0,133
0,06
0,054
0,401
0,126
0,124
0,143
0,09
0,135
0,176
0,089
0,117
0,094
0,093
0,111
0,482
0,06
0,07
0,205
0,076
0,066
0,14
0,129
0,161
0,197
0,155
0,101
0,446
0,08
0,127
0,275
0,072
0,152
0,045
0,09
0,211
0,149
0,07
0,102
0,109
0,096
0,046
0,082
0,043

0,098
0,626
0,107
0,164
0,074
0,217
0,764
0,107
0,49
0,13
0,104
0,148
0,157
0,164
0,191
0,038
0,059
0,162
0,179
0,527
0,061
0,148
0,068
0,052
0,13
0,148
0,496
0,41
0,088
0,516
0,284
0,104
0,054
0,056
0,145
0,513
0,259
0,021
0,322
0,111
0,069
0,347
0,248
0,206
0,137
0,106
0,028

0,173
1,166
0,178
0,126
0,223
0,316
0,101
0,299
0,2
0,198
0,127
0,206
0,099
0,471
0,09
0,194
0,169
0,413
0,17
0,275
0,282
0,185
0,118
0,256
0,259
0,73
0,155
0,373
0,196
0,249
0,178
0,18
0,235
0,177
0,254
0,385
0,22
0,049
0,4
0,524
0,697
0,215
0,059
0,941
0,366
0,299
0,148

0,15
0,154
0,121
0,13
0,093
0,181
0,076
0,119
0,155
0,258
0,063
0,184
0,757
0,067
0,054
0,433
0,116
0,164
0,271
0,093
0,136
0,179
0,297
0,079
0,124
0,123
0,114
0,18
0,11
0,098
0,244
0,101
0,128
0,198
0,077
0,101
0,038
0,001
0,108
0,109
0,053
0,124
0,028
0,098
0,06
0,062
0,081

1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

0,082
0,082
0,126
0,118
0,176
0,16
0,08
0,104
0,014
0
0,28
0,108
0,12
0,072
0,052
0,09
0,1
0,082
0,08
0,032
0,006
0,074
0,096
0,14
0,182
0,08
0,09
0,064
0,078
0,036
0,012
0,022
0,016
0
0,138
0,128
0,104
0,074
0,232
0,192
0,104
0,22
0,09
0,072
0,2
0,006
0,092

0,029
0,085
0,046
0,096
0,096
0,447
0,08
0,304
0,087
0,047
0,332
0,011
0,04
0,095
0,021
0,266
0,046
0,03
0,029
0,113
0,051
0,113
0,099
0,004
0,097
0,106
0,057
0,08
0,059
0,07
0,124
0,207
0,108
0,074
0,296
0,091
0,125
0,074
0,2
0,269
0,111
0,199
0,157
0,165
0,213
0,061
0,143

0,314
0,06
0,136
1,535
0,145
0,223
0,098
0,398
0,771
0,135
0,217
0,063
0,116
0,088
0,077
0,154
0,086
0,028
0,055
0,405
0,092
0,172
0,085
0,119
0,053
0,172
0,101
0,121
0,079
0,24
0,221
0,235
0,088
0,085
0,149
0,119
0,154
0,062
0,118
0,353
0,332
0,194
0,115
0,261
0,191
0,209
0,066

0,04
0,014
0,212
0,205
0,139
0,707
0,107
0,176
0,096
0,055
0,111
0,178
0,034
0,027
0,114
0,043
0,02
0,007
0,029
0,094
0,122
0,078
0,051
0,087
0,052
0,069
0,173
0,013
0,078
0,072
0,138
0,113
0,153
0,194
0,176
0,185
0,211
0,051
0,293
0,126
0,355
0,09
0,163
0,124
0,645
0,191
0,073

0,091
0,062
0,149
0,072
0,134
0,165
0,027
0,602
0,221
0,075
0,09
0,126
0,056
0,134
0,061
0,062
0,03
0,059
0,074
0,16
0,104
0,43
0,094
0,098
0,11
0,09
0,134
0,05
0,04
0,118
0,117
0,277
0,158
0,485
0,184
0,157
0,165
0,168
0,285
0,216
0,102
0,198
0,165
0,573
0,253
0,282
0,122

0,483
0,16
0,602
0,078
0,219
0,19
0,233
0,424
0,119
0,096
0,223
0,167
0,338
0,482
0,312
0,333
0,045
0,007
0,013
0,277
0,201
0,14
0,064
0,097
0,2
0,127
0,2
0,021
0,091
0,069
0,34
0,761
0,135
0,257
0,398
0,191
0,122
0,211
0,459
0,153
0,122
0,411
1,706
0,318
0,157
0,285
0,097

0,089
0,064
0,274
0,222
0,215
0,329
0,262
0,6
0,252
0,054
0,403
0,175
0,082
0,099
0,096
0,059
0,079
0
0
0,165
0,148
0,474
0,131
0,133
0,022
0,205
0,267
0
0,091
0,109
0,106
0,788
0,21
0,252
0,195
0,109
0,146
0,163
0,116
0,301
0,331
0,247
0,338
0,267
0,484
0,175
0,185

2,223
0,021
0,502
0,107
0,114
0,191
0,12
0,06
0,122
0,043
0,062
0,104
0,153
0,055
0,093
0,051
0,032
0
0,008
0,185
0,167
0,085
0,029
0,075
0,043
0,122
0,122
0,044
0,064
0,09
0,076
0,077
0,131
0,121
0,112
0,104
0,091
0,036
0,26
0,125
0,069
0,167
0,223
0,112
0,316
3,743
0,048

1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

0,166
0,214
0,156
0,074
0,182
0,1
0,026
0,05
0,084
0,058
0
0,028
0,026
0,234
0,27
0,132

0,021
0,07
0,138
0,105
0,179
0,102
0,048
0,111
0,256
0,135
0,071
0,173
0,005
0,116
0,199
0,09

0,062
0,139
0,18
0,04
0,112
0,211
0,249
0,062
0,397
0,099
0,245
0,16
0,125
0,117
0,193
0,101

0,178
0,159
0,165
0,126
0,062
0,389
0,216
0,114
0,125
0,233
0,081
0,09
0,117
0,073
0,147
0,159

0,149
0,347
0,29
0,002
0,112
0,371
0,165
0,154
0,259
0,155
0,126
0,058
0,088
0,019
0,171
0,083

0,12
0,147
0,493
0,028
0,089
0,205
0,106
0,064
0,239
0,096
0,066
0,144
0,106
0,135
0,446
0,152

0,279
0,422
0,543
-0,01
0,351
0,514
0,193
0,109
0,477
0,304
0,094
0,128
0,183
0,086
0,368
0,027

0,139
0,167
0,135
0,147
0,064
0,23
0,26
0,113
0,684
0,113
0,064
0,12
0,078
0,076
0,112
0,059

P62

P90
0,177
0,049
0,28
0,104
0,107
0,128
0,253
0,161
0,188
0,108
0,087
0,108
0,049
0,071
0,071
0,185
0,165
0,347
0,121
0,149
0,2
0,195
0,113
0,213
0,128
0,053
0,157
0,187
0,068
0,153
0,304
0,059
0,091
0,148
0,052
0,119
0,089
0,047
0,173
0,196
0,143
0,064
0,149
0,123
0,117
0,255

RalA
0,097
0,011
0,05
0,049
0,019
0,027
0,06
0,058
0,037
0,064
0,025
0,05
0,029
0,029
0,039
0,452
0,11
0,082
0,047
0,031
0,083
0,116
0,056
0,079
0,019
0,024
0,013
0,042
0,037
0,064
0,127
0,055
0,065
0,039
0,029
0,029
0,028
0,033
0,057
0,108
0,054
0,039
0,077
0,058
0,038
0,041

0,146
0,054
0,167
0,1
0,082
0,157
0,103
0,127
0,145
0,14
0,12
0,118
0,068
0,143
0,272
0,157
0,181
0,245
0,084
0,096
0,165
0,089
0,175
0,151
0,067
0,164
0,088
0,149
0,07
0,143
0,109
0,071
0,141
0,111
0,095
0,128
0,078
0,062
0,12
0,195
0,155
0,177
0,092
0,096
0,101
0,075

Survivin
0,116
0,03
0,102
0,062
0,052
0,372
0,106
0,07
0,074
0,128
0,082
0,074
0,06
0,068
0,376
0,098
0,114
0,144
0,056
0,062
0,138
0,108
0,094
0,088
0,038
0,038
0,05
0,082
0,056
0,074
0,084
0,05
0,1
0,104
0,058
0,04
0,042
0,018
0,056
0,08
0,084
0,108
0,056
0,046
0,062
0,088

0,227
0,075
0,136
0,019
0,089
0,08
0,133
0,091
0,175
0,103
0,077
0,156
0,032
0,08
0,123
0,22
0,043
0,023
0,161
0,057
0,048
0,081
0,056
0,239
0,075
0,076
0,08
0,076
0,048
0,036
0,172
0,015
0,103
0,057
0,089
0,248
0,131
0,049
0,088
0,168
0,096
0,093
0,043
0,033
0,229
0,192
0,234

0,075
0,047
0,038
0,02
0,06
0,066
0,117
0,029
0,06
0,065
0,048
0,059
0,019
0,039
0,026
0,098
0,031
0,016
0,038
0,029
0,034
0,031
0,07
0,043
0,024
0,04
0,037
0,02
0,033
0,04
0,05
0,022
0,062
0,021
0,029
0,053
0,028
0,043
0,072
0,069
0,04
0,051
0,029
0,044
0,185
0,088
0,095

0,215
0,08
0,112
0,062
0,117
0,135
0,136
0,124
0,1
0,088
0,105
0,133
0,093
0,082
0,111
0,26
0,082
0,061
0,159
0,076
0,042
0,128
0,111
0,095
0,094
0,099
0,094
0,044
0,065
0,1
0,195
0,057
0,093
0,076
0,083
0,137
0,067
0,213
0,062
0,211
0,112
0,188
0,08
0,058
0,153
0,125
0,198

0,2
0,038
0,036
0,022
0,052
0,03
0,07
0,11
0,076
0,072
0,048
0,088
0,032
0,096
0,068
0,142
0,046
0,022
0,05
0,044
0,02
0,046
0,038
0,068
0,054
0,058
0,066
0,04
0,046
0,022
0,102
0,036
0,054
0,034
0,056
0,06
0,026
0,148
0,066
0,112
0,042
0,058
0,024
0,02
0,229
0,083
0,083

0,436
0,214
0,776
0,226
0,364
0,298
0,302
0,357
0,284
0,295
0,183
0,195
0,406
0,237
0,234
0,26
0,214
0,568
0,254
0,439
0,233
0,418
0,226
0,35
0,398
0,225
0,218
0,399
0,234
0,117
0,329
0,592
0,267
0,197
0,184
0,198
0,35
0,281
0,397
0,29
0,201
0,149
0,314
0,296
0,105
0,231
0,155

0,307
0,11
0,529
0,154
0,127
0,143
0,228
0,169
0,095
0,325
0,125
0,092
0,33
0,124
0,137
0,067
0,092
0,255
0,06
0,258
0,102
0,218
0,142
0,164
0,277
0,152
0,079
0,109
0,181
0,056
0,134
0,195
0,142
0,224
0,045
0,06
0,185
0,121
0,201
0,162
0,198
0,076
0,179
0,18
0,065
0,209
0,069

0,349
0,228
0,555
0,095
0,224
0,34
0,282
0,277
0,212
0,194
0,146
0,213
0,182
0,119
0,231
0,143
0,133
0,515
0,145
0,291
0,06
0,141
0,193
0,265
0,272
0,148
0,119
0,177
0,182
0,122
0,415
0,478
0,129
0,095
0,162
0,261
0,173
0,225
0,303
0,09
0,186
0,123
0,18
0,324
0,091
0,135
0,159

0,509
0,12
0,292
0,153
0,213
0,064
0,368
0,107
0,12
0,162
0,11
0,093
0,167
0,079
0,084
0,062
0,148
0,217
0,089
0,098
0,107
0,126
0,069
0,179
0,193
0,134
0,244
0,175
0,083
0,1
0,186
0,163
0,084
0,157
0,127
0,138
0,212
0,229
0,131
0,041
0,138
0,036
0,127
0,193
0,072
0,16
0,058

0,302
0,907
0,27
0,23
0,326
0,301
0,152
0,242
0,292
0,135
0,198
0,204
0,192
0,401
0,159
0,192
0,286
0,517
0,328
0,322
0,401
0,181
0,18
0,227
0,306
0,663
0,201
0,372
0,341
0,253
0,215
0,259
0,201
0,96
0,156
3,347
0,055
0
0,312
0,229
0,468
0,122
0,403
0,169
0,27
0,447
0,19

0,078
0,66
0,099
0,244
0,07
0,076
0,102
0,149
0,131
0,059
0,123
0,117
0,103
0,177
0,088
0,077
0,13
0,317
0,092
0,074
0,13
0,032
0,068
0,129
0,112
0,451
0,138
0,28
0,213
0,129
0,104
0,133
0,184
0,105
0,109
0,224
0,269
0,02
0,129
0,259
0,24
0,085
0,085
0,175
0,165
0,109
0,059

0,218
0,563
0,17
0,157
0,237
0,285
0,138
0,25
0,263
0,148
0,101
0,26
0,162
0,174
0,092
0,187
0,195
0,528
0,343
0,216
0,242
0,146
0,179
0,262
0,217
0,274
0,147
0,364
0,223
0,219
0,258
0,231
0,299
0,231
0,227
0,406
0,153
0,012
0,384
0,278
0,308
0,116
0,052
0,158
0,114
0,195
0,238

0,141
0,681
0,208
0,148
0,126
0,141
0,041
0,151
0,258
0,157
0,129
0,131
0,139
0,205
0,06
0,058
0,107
0,234
0,284
0,158
0,179
0,095
0,131
0,208
0,198
0,599
0,141
0,287
0,248
0,174
0,136
0,216
0,396
0,187
0,143
0,186
0,067
0,027
0,111
0,115
0,129
0,087
0,042
0,139
0,223
0,078
0,084

1,56
0
0,205
0,07
0,081
0,309
0,127
0,697
0,237
0,099
0,764
0,151
0,203
0,026
0,073
0,07
0,042
0
0,01
0,554
0,164
0,286
0,125
0,14
0
0,036
0,107
0
0,06
0,13
0,203
0,315
0,107
0,364
0,361
0,112
0,06
0,094
0,14
0,198
0,12
0,393
0,213
0,208
0,437
0,237
0,06

0,182
0,09
0,164
0,133
0,153
0,074
0,097
0,174
0,081
0,034
0,089
0,148
0,176
0,081
0,216
0,087
0,076
0,001
0,021
0,108
0,055
0,062
0,055
0,089
0,062
0,134
0,111
0,06
0,072
0,103
0,137
0,189
0,114
0,117
0,082
0,095
0,151
0,143
0,103
0,289
0,163
0,137
0,224
0,163
0,16
0,118
0,06

0,266
0,033
0,35
0,261
0,27
0,354
0,184
0,75
0,336
0,093
0,295
0,271
0,079
0,181
0,126
0,114
0,237
0
0,013
0,442
0,449
0,166
0,064
0,123
0,071
0,062
0,093
0,015
0,123
0,148
0,156
0,348
0,214
0,206
0,124
0,181
0,21
0,078
0,226
0,326
0,132
0,488
0,454
0,442
0,35
0,282
0,107

0,105
0,035
0,287
0,08
0,183
0,181
0,134
0,139
0,155
0,049
0,153
0,225
0,078
0,076
0,344
0,057
0,053
0,036
0,069
0,21
0,3
0,087
0,045
0,202
0,141
0,08
0,248
0,045
0,134
0,223
0,239
0,154
0,202
0,336
0,172
0,329
0,157
0,092
0,683
0,206
0,224
0,42
0,542
0,29
0,798
1,291
0,085

0,159
0,439
0,052
0
0,052
0,577
0,14
0,073
0,393
0,195
0,091
0,078
0
0
0,237
0

0,095
0,073
0,149
0,043
0,141
0,156
0,081
0,092
0,225
0,109
0,074
0,053
0,092
0,223
0,153
0,103

0,131
0,311
0,216
0,042
0,222
0,604
0,468
0,126
0,243
0,125
0,039
0,058
0,086
0,037
0,107
0,02

0,346
0,122
0,232
0,346
0,095
0,683
0,412
0,238
0,216
0,241
0,099
0,101
2,76
0,245
0,196
0,232

Tukey-Kramer Multiple Comparisons

Group
1: groupid
2: Ab14
3: HCC1
4: IMP1
5: KOC
6: MDM2
7: NPM1
8: P16
9: P53
10: P62
11: P90
12: RalA
13: Survivin

Sample
Mean
0,64
0,0928
0,098868
0,18096
0,101496
0,126372
0,19934
0,20158
0,133644
0,218692
0,108632
0,179652
0,156636

Other Data
Level of significance
0,05
Numerator d.f.
13
Denominator d.f.
3237
MSW
0,052594
Q Statistic
5,16

Sample
Size
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250

Comparison
Group 1 to Group 2
Group 1 to Group 3
Group 1 to Group 4
Group 1 to Group 5
Group 1 to Group 6
Group 1 to Group 7
Group 1 to Group 8
Group 1 to Group 9
Group 1 to Group 10
Group 1 to Group 11
Group 1 to Group 12
Group 1 to Group 13
Group 2 to Group 3
Group 2 to Group 4
Group 2 to Group 5
Group 2 to Group 6
Group 2 to Group 7
Group 2 to Group 8
Group 2 to Group 9
Group 2 to Group 10
Group 2 to Group 11
Group 2 to Group 12
Group 2 to Group 13
Group 3 to Group 4
Group 3 to Group 5
Group 3 to Group 6
Group 3 to Group 7
Group 3 to Group 8
Group 3 to Group 9
Group 3 to Group 10
Group 3 to Group 11
Group 3 to Group 12
Group 3 to Group 13
Group 4 to Group 5
Group 4 to Group 6
Group 4 to Group 7
Group 4 to Group 8
Group 4 to Group 9
Group 4 to Group 10
Group 4 to Group 11
Group 4 to Group 12
Group 4 to Group 13
Group 5 to Group 6

Absolute
Std. Error
Difference of Difference
0,5472 0,014504391
0,541132 0,014504391
0,45904 0,014504391
0,538504 0,014504391
0,513628 0,014504391
0,44066 0,014504391
0,43842 0,014504391
0,506356 0,014504391
0,421308 0,014504391
0,531368 0,014504391
0,460348 0,014504391
0,483364 0,014504391
0,006068 0,014504391
0,08816 0,014504391
0,008696 0,014504391
0,033572 0,014504391
0,10654 0,014504391
0,10878 0,014504391
0,040844 0,014504391
0,125892 0,014504391
0,015832 0,014504391
0,086852 0,014504391
0,063836 0,014504391
0,082092 0,014504391
0,002628 0,014504391
0,027504 0,014504391
0,100472 0,014504391
0,102712 0,014504391
0,034776 0,014504391
0,119824 0,014504391
0,009764 0,014504391
0,080784 0,014504391
0,057768 0,014504391
0,079464 0,014504391
0,054588 0,014504391
0,01838 0,014504391
0,02062 0,014504391
0,047316 0,014504391
0,037732 0,014504391
0,072328 0,014504391
0,001308 0,014504391
0,024324 0,014504391
0,024876 0,014504391

Group 5 to Group 7
Group 5 to Group 8
Group 5 to Group 9
Group 5 to Group 10
Group 5 to Group 11
Group 5 to Group 12
Group 5 to Group 13
Group 6 to Group 7
Group 6 to Group 8
Group 6 to Group 9
Group 6 to Group 10
Group 6 to Group 11
Group 6 to Group 12
Group 6 to Group 13
Group 7 to Group 8
Group 7 to Group 9
Group 7 to Group 10
Group 7 to Group 11
Group 7 to Group 12
Group 7 to Group 13
Group 8 to Group 9
Group 8 to Group 10
Group 8 to Group 11
Group 8 to Group 12
Group 8 to Group 13
Group 9 to Group 10
Group 9 to Group 11
Group 9 to Group 12
Group 9 to Group 13
Group 10 to Group 11
Group 10 to Group 12
Group 10 to Group 13
Group 11 to Group 12
Group 11 to Group 13
Group 12 to Group 13

0,097844
0,100084
0,032148
0,117196
0,007136
0,078156
0,05514
0,072968
0,075208
0,007272
0,09232
0,01774
0,05328
0,030264
0,00224
0,065696
0,019352
0,090708
0,019688
0,042704
0,067936
0,017112
0,092948
0,021928
0,044944
0,085048
0,025012
0,046008
0,022992
0,11006
0,03904
0,062056
0,07102
0,048004
0,023016

0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391
0,014504391

Critical
Range
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748

Results
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different

0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748
0,0748

Means are different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different
Means are not different

ANOVA: Single Factor
SUMMARY
Groups
groupid
Ab14
HCC1
IMP1
KOC
MDM2
NPM1
P16
P53
P62
P90
RalA
Survivin

Calculations
c
13
n
3250
Count
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250
250

Sum
160
23,2
24,717
45,24
25,374
31,593
49,835
50,395
33,411
54,673
27,158
44,913
39,159

ANOVA
Source of Variation
Between Groups
Within Groups

SS
61,0505
170,2479

df

Total

231,2984

3249

12
3237

Average Variance
0,64
0,2313
0,0928
0,0053
0,098868
0,0080
0,18096
0,1068
0,101496
0,0259
0,126372
0,0090
0,19934
0,0526
0,20158
0,0258
0,133644
0,0804
0,218692
0,0706
0,108632
0,0075
0,179652
0,0134
0,156636
0,0470

MS
5,0875
0,0526

F
P-value F crit
96,7318 0,0000 1,7552

Level of significance

0,05

Thus, there is enough evidence that we can effectively discriminate between the cases
and controls on the basis of the levels of these TAAs. This is because the overall p-value
is less than 0.05 level of signficance and the null hypothesis rejected. This is observed in
ANOVA and Tukey Kramer method

Sample
P16
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
groupid
gro...

Lessermaster (15344)
UT Austin

Anonymous
Top quality work from this tutor! I’ll be back!

Anonymous
It’s my second time using SP and the work has been great back to back :) The one and only resource on the Interwebs for the work that needs to be done!

Anonymous
Thanks, good work

Studypool
4.7
Trustpilot
4.5
Sitejabber
4.4

Brown University





1271 Tutors

California Institute of Technology




2131 Tutors

Carnegie Mellon University




982 Tutors

Columbia University





1256 Tutors

Dartmouth University





2113 Tutors

Emory University





2279 Tutors

Harvard University





599 Tutors

Massachusetts Institute of Technology



2319 Tutors

New York University





1645 Tutors

Notre Dam University





1911 Tutors

Oklahoma University





2122 Tutors

Pennsylvania State University





932 Tutors

Princeton University





1211 Tutors

Stanford University





983 Tutors

University of California





1282 Tutors

Oxford University





123 Tutors

Yale University





2325 Tutors